Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms