Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
GJB4Q9NTQ9 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
GJB4Q9NTQ9 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms