Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC4BQ9NT99 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms