Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNTG1Q9NSN8 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms