Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC6A13Q9NSD5 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms