Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms