Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
INCENPQ9NQS7 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms