Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TIMMDC1Q9NPL8 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms