Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
A4GALTQ9NPC4 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms