Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms