Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP62

GCM1, Chorion-specific transcription factor GCMa, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCM1Q9NP62 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCM1Q9NP62 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms