Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GOPCQ9HD26 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GOPCQ9HD26 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GOPCQ9HD26 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GOPCQ9HD26 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GOPCQ9HD26 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GOPCQ9HD26 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GOPCQ9HD26 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GOPCQ9HD26 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GOPCQ9HD26 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GOPCQ9HD26 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GOPCQ9HD26 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GOPCQ9HD26 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GOPCQ9HD26 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GOPCQ9HD26 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOPCQ9HD26 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOPCQ9HD26 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOPCQ9HD26 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOPCQ9HD26 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOPCQ9HD26 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOPCQ9HD26 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOPCQ9HD26 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOPCQ9HD26 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOPCQ9HD26 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOPCQ9HD26 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GOPCQ9HD26 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GOPCQ9HD26 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOPCQ9HD26 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOPCQ9HD26 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOPCQ9HD26 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOPCQ9HD26 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOPCQ9HD26 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOPCQ9HD26 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOPCQ9HD26 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOPCQ9HD26 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOPCQ9HD26 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOPCQ9HD26 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOPCQ9HD26 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GOPCQ9HD26 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GOPCQ9HD26 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GOPCQ9HD26 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GOPCQ9HD26 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GOPCQ9HD26 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GOPCQ9HD26 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GOPCQ9HD26 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GOPCQ9HD26 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GOPCQ9HD26 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GOPCQ9HD26 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GOPCQ9HD26 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GOPCQ9HD26 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GOPCQ9HD26 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GOPCQ9HD26 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GOPCQ9HD26 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GOPCQ9HD26 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GOPCQ9HD26 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GOPCQ9HD26 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GOPCQ9HD26 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GOPCQ9HD26 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GOPCQ9HD26 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GOPCQ9HD26 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GOPCQ9HD26 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GOPCQ9HD26 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GOPCQ9HD26 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GOPCQ9HD26 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GOPCQ9HD26 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GOPCQ9HD26 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
GOPCQ9HD26 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOPCQ9HD26 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOPCQ9HD26 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOPCQ9HD26 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOPCQ9HD26 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOPCQ9HD26 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOPCQ9HD26 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOPCQ9HD26 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOPCQ9HD26 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOPCQ9HD26 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOPCQ9HD26 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GOPCQ9HD26 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOPCQ9HD26 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOPCQ9HD26 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOPCQ9HD26 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOPCQ9HD26 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GOPCQ9HD26 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOPCQ9HD26 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOPCQ9HD26 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOPCQ9HD26 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOPCQ9HD26 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOPCQ9HD26 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOPCQ9HD26 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GOPCQ9HD26 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GOPCQ9HD26 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GOPCQ9HD26 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GOPCQ9HD26 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GOPCQ9HD26 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GOPCQ9HD26 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GOPCQ9HD26 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GOPCQ9HD26 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GOPCQ9HD26 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
GOPCQ9HD26 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GOPCQ9HD26 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms