Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CENPJQ9HC77 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CENPJQ9HC77 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms