Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NYXQ9GZU5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NYXQ9GZU5 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms