Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU1

MCOLN1, Mucolipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN1Q9GZU1 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCOLN1Q9GZU1 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCOLN1Q9GZU1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCOLN1Q9GZU1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MCOLN1Q9GZU1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCOLN1Q9GZU1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCOLN1Q9GZU1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCOLN1Q9GZU1 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCOLN1Q9GZU1 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCOLN1Q9GZU1 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MCOLN1Q9GZU1 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCOLN1Q9GZU1 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MCOLN1Q9GZU1 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCOLN1Q9GZU1 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MCOLN1Q9GZU1 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MCOLN1Q9GZU1 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCOLN1Q9GZU1 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCOLN1Q9GZU1 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCOLN1Q9GZU1 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCOLN1Q9GZU1 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCOLN1Q9GZU1 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCOLN1Q9GZU1 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MCOLN1Q9GZU1 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCOLN1Q9GZU1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCOLN1Q9GZU1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCOLN1Q9GZU1 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCOLN1Q9GZU1 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCOLN1Q9GZU1 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCOLN1Q9GZU1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCOLN1Q9GZU1 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCOLN1Q9GZU1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCOLN1Q9GZU1 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCOLN1Q9GZU1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCOLN1Q9GZU1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCOLN1Q9GZU1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCOLN1Q9GZU1 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCOLN1Q9GZU1 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCOLN1Q9GZU1 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCOLN1Q9GZU1 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCOLN1Q9GZU1 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCOLN1Q9GZU1 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCOLN1Q9GZU1 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCOLN1Q9GZU1 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCOLN1Q9GZU1 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCOLN1Q9GZU1 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCOLN1Q9GZU1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCOLN1Q9GZU1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCOLN1Q9GZU1 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCOLN1Q9GZU1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCOLN1Q9GZU1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCOLN1Q9GZU1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCOLN1Q9GZU1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCOLN1Q9GZU1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCOLN1Q9GZU1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MCOLN1Q9GZU1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
MCOLN1Q9GZU1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCOLN1Q9GZU1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MCOLN1Q9GZU1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCOLN1Q9GZU1 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCOLN1Q9GZU1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCOLN1Q9GZU1 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCOLN1Q9GZU1 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCOLN1Q9GZU1 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCOLN1Q9GZU1 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCOLN1Q9GZU1 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCOLN1Q9GZU1 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCOLN1Q9GZU1 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCOLN1Q9GZU1 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCOLN1Q9GZU1 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MCOLN1Q9GZU1 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCOLN1Q9GZU1 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MCOLN1Q9GZU1 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCOLN1Q9GZU1 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCOLN1Q9GZU1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCOLN1Q9GZU1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCOLN1Q9GZU1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCOLN1Q9GZU1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCOLN1Q9GZU1 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCOLN1Q9GZU1 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCOLN1Q9GZU1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCOLN1Q9GZU1 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCOLN1Q9GZU1 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MCOLN1Q9GZU1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCOLN1Q9GZU1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCOLN1Q9GZU1 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCOLN1Q9GZU1 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCOLN1Q9GZU1 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCOLN1Q9GZU1 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCOLN1Q9GZU1 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCOLN1Q9GZU1 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCOLN1Q9GZU1 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MCOLN1Q9GZU1 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCOLN1Q9GZU1 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCOLN1Q9GZU1 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MCOLN1Q9GZU1 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCOLN1Q9GZU1 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCOLN1Q9GZU1 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MCOLN1Q9GZU1 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCOLN1Q9GZU1 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCOLN1Q9GZU1 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms