Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
MAP1LC3CQ9BXW4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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