Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TDRD1Q9BXT4 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms