Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWT1

CDCA7, Cell division cycle-associated protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA7Q9BWT1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDCA7Q9BWT1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDCA7Q9BWT1 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDCA7Q9BWT1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms