Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms