Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2AFJQ9BTM1 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms