Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT17Q9BSW7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT17Q9BSW7 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT17Q9BSW7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT17Q9BSW7 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT17Q9BSW7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT17Q9BSW7 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT17Q9BSW7 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT17Q9BSW7 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT17Q9BSW7 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT17Q9BSW7 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT17Q9BSW7 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT17Q9BSW7 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT17Q9BSW7 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT17Q9BSW7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT17Q9BSW7 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT17Q9BSW7 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT17Q9BSW7 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT17Q9BSW7 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT17Q9BSW7 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYT17Q9BSW7 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYT17Q9BSW7 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYT17Q9BSW7 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYT17Q9BSW7 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYT17Q9BSW7 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYT17Q9BSW7 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYT17Q9BSW7 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYT17Q9BSW7 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYT17Q9BSW7 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYT17Q9BSW7 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYT17Q9BSW7 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SYT17Q9BSW7 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYT17Q9BSW7 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYT17Q9BSW7 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYT17Q9BSW7 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYT17Q9BSW7 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYT17Q9BSW7 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYT17Q9BSW7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYT17Q9BSW7 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYT17Q9BSW7 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYT17Q9BSW7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms