Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGIP1Q9BQI5 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms