Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms