Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSF3RQ99062 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSF3RQ99062 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSF3RQ99062 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSF3RQ99062 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSF3RQ99062 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms