Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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