Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC38A2Q96QD8 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC38A2Q96QD8 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms