Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW7

LRRC7, Leucine-rich repeat-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC7Q96NW7 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
LRRC7Q96NW7 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC7Q96NW7 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms