Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSNARE1Q96NA8 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms