Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 AC003075.1-208ENST00000415246 596 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 BMS1P13-201ENST00000417301 885 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 BMS1P11-201ENST00000442351 885 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 BMS1P9-201ENST00000457640 885 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 AC090772.3-201ENST00000583267 735 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 TPT1-AS1-221ENST00000618947 520 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 SEPT14P1-201ENST00000458703 648 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 AC084824.3-201ENST00000620472 856 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 AC002044.3-201ENST00000623314 541 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 CCL11-201ENST00000305869 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MS4A3Q96HJ5 MTND2P12-201ENST00000417560 1252 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms