Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC34Q96HJ3 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms