Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms