Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SIRT1Q96EB6 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIRT1Q96EB6 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms