Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTP4Q96DX8 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms