Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAF2Q96CS3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAF2Q96CS3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAF2Q96CS3 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAF2Q96CS3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAF2Q96CS3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAF2Q96CS3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAF2Q96CS3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAF2Q96CS3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAF2Q96CS3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAF2Q96CS3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAF2Q96CS3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAF2Q96CS3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAF2Q96CS3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAF2Q96CS3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAF2Q96CS3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAF2Q96CS3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAF2Q96CS3 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAF2Q96CS3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAF2Q96CS3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAF2Q96CS3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAF2Q96CS3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
FAF2Q96CS3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAF2Q96CS3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAF2Q96CS3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAF2Q96CS3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAF2Q96CS3 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAF2Q96CS3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAF2Q96CS3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAF2Q96CS3 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAF2Q96CS3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAF2Q96CS3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAF2Q96CS3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAF2Q96CS3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAF2Q96CS3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAF2Q96CS3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAF2Q96CS3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAF2Q96CS3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAF2Q96CS3 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAF2Q96CS3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
FAF2Q96CS3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAF2Q96CS3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAF2Q96CS3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAF2Q96CS3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAF2Q96CS3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAF2Q96CS3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
FAF2Q96CS3 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms