Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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FAM3DQ96BQ1 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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FAM3DQ96BQ1 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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FAM3DQ96BQ1 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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FAM3DQ96BQ1 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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