Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GTF3C6Q969F1 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms