Protein–RNA interactions for Protein: Q92879

CELF1, CUGBP Elav-like family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF1Q92879 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms