Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms