Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAAF4Q8WXU2 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms