Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNAJA4Q8WW22 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNAJA4Q8WW22 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNAJA4Q8WW22 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNAJA4Q8WW22 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNAJA4Q8WW22 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJA4Q8WW22 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJA4Q8WW22 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJA4Q8WW22 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJA4Q8WW22 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJA4Q8WW22 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJA4Q8WW22 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJA4Q8WW22 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJA4Q8WW22 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJA4Q8WW22 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJA4Q8WW22 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJA4Q8WW22 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJA4Q8WW22 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJA4Q8WW22 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJA4Q8WW22 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJA4Q8WW22 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJA4Q8WW22 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJA4Q8WW22 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJA4Q8WW22 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJA4Q8WW22 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJA4Q8WW22 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJA4Q8WW22 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJA4Q8WW22 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJA4Q8WW22 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJA4Q8WW22 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJA4Q8WW22 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJA4Q8WW22 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJA4Q8WW22 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJA4Q8WW22 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJA4Q8WW22 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJA4Q8WW22 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJA4Q8WW22 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJA4Q8WW22 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJA4Q8WW22 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJA4Q8WW22 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJA4Q8WW22 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNAJA4Q8WW22 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJA4Q8WW22 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJA4Q8WW22 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJA4Q8WW22 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJA4Q8WW22 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJA4Q8WW22 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJA4Q8WW22 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJA4Q8WW22 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJA4Q8WW22 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJA4Q8WW22 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJA4Q8WW22 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJA4Q8WW22 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJA4Q8WW22 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJA4Q8WW22 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJA4Q8WW22 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJA4Q8WW22 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJA4Q8WW22 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJA4Q8WW22 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJA4Q8WW22 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJA4Q8WW22 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJA4Q8WW22 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJA4Q8WW22 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJA4Q8WW22 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJA4Q8WW22 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJA4Q8WW22 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJA4Q8WW22 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJA4Q8WW22 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJA4Q8WW22 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJA4Q8WW22 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJA4Q8WW22 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJA4Q8WW22 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
DNAJA4Q8WW22 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJA4Q8WW22 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJA4Q8WW22 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJA4Q8WW22 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJA4Q8WW22 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJA4Q8WW22 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJA4Q8WW22 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJA4Q8WW22 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJA4Q8WW22 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJA4Q8WW22 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJA4Q8WW22 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJA4Q8WW22 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJA4Q8WW22 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJA4Q8WW22 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJA4Q8WW22 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJA4Q8WW22 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJA4Q8WW22 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJA4Q8WW22 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJA4Q8WW22 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJA4Q8WW22 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJA4Q8WW22 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJA4Q8WW22 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJA4Q8WW22 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJA4Q8WW22 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJA4Q8WW22 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJA4Q8WW22 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJA4Q8WW22 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJA4Q8WW22 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms