Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ0

HAVCR2, Hepatitis A virus cellular receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAVCR2Q8TDQ0 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HAVCR2Q8TDQ0 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HAVCR2Q8TDQ0 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms