Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEDD1Q8NHV4 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms