Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC112Q8NEF3 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms