Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC197Q8NCU1 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms