Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms