Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Q1

FAM71E2, Protein FAM71E2, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71E2Q8N5Q1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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FAM71E2Q8N5Q1 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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FAM71E2Q8N5Q1 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM71E2Q8N5Q1 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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