Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC83Q8IWF9 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms