Protein–RNA interactions for Protein: Q86V59

PNMA8A, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8AQ86V59 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PNMA8AQ86V59 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PNMA8AQ86V59 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PNMA8AQ86V59 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PNMA8AQ86V59 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PNMA8AQ86V59 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PNMA8AQ86V59 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PNMA8AQ86V59 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PNMA8AQ86V59 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PNMA8AQ86V59 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PNMA8AQ86V59 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PNMA8AQ86V59 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PNMA8AQ86V59 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PNMA8AQ86V59 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PNMA8AQ86V59 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PNMA8AQ86V59 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PNMA8AQ86V59 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PNMA8AQ86V59 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PNMA8AQ86V59 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PNMA8AQ86V59 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PNMA8AQ86V59 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PNMA8AQ86V59 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PNMA8AQ86V59 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PNMA8AQ86V59 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PNMA8AQ86V59 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PNMA8AQ86V59 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PNMA8AQ86V59 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PNMA8AQ86V59 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PNMA8AQ86V59 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PNMA8AQ86V59 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PNMA8AQ86V59 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PNMA8AQ86V59 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PNMA8AQ86V59 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PNMA8AQ86V59 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PNMA8AQ86V59 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PNMA8AQ86V59 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PNMA8AQ86V59 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PNMA8AQ86V59 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PNMA8AQ86V59 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PNMA8AQ86V59 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PNMA8AQ86V59 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PNMA8AQ86V59 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PNMA8AQ86V59 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PNMA8AQ86V59 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PNMA8AQ86V59 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PNMA8AQ86V59 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PNMA8AQ86V59 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PNMA8AQ86V59 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PNMA8AQ86V59 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PNMA8AQ86V59 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PNMA8AQ86V59 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PNMA8AQ86V59 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PNMA8AQ86V59 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PNMA8AQ86V59 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PNMA8AQ86V59 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PNMA8AQ86V59 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PNMA8AQ86V59 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PNMA8AQ86V59 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PNMA8AQ86V59 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PNMA8AQ86V59 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PNMA8AQ86V59 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PNMA8AQ86V59 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PNMA8AQ86V59 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PNMA8AQ86V59 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PNMA8AQ86V59 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms