Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HAPLN4Q86UW8 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
HAPLN4Q86UW8 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms