Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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